В ночь с 11 на 12 июня 2013 года, накануне отдания Пасхи, в Свято-Духовском кафедральном соборе Херсона Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн совершил утреню и Божественную Литургию Пасхальным чином. По окончании Литургии состоялся Крестный ход вокруг храма, затем из алтаря была изнесена Плащаница Спасителя для поклонения верующих, сердца которых снова были переполнены пасхальной радостью, как в Пасхальную ночь Светлого Христова Воскресения.

11 июня 2013 года, в день, когда Святая Церковь чтит память святителя Луки Крымского, после совершения Божественной Литургии Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн возглавил молебен в церкви святителя Луки при Херсонском областном кардиологическом диспансере. Владыка Иоанн тепло поздравил настоятеля и прихожан с престольным праздником и с 15-летием открытия больничного храма, который на тот момент был первым при медицинских учреждениях Херсонской епархии.

10 июня 2013 года в храме святой равноапостольной Нины, просветительницы Грузии, духовенство, во главе с Архиепископом Херсонским и Таврическим Иоанном, и верующие праздновали день памяти подвижницы благочестия Херсонского края – блаженной Домники Алешковской, в 2009 году причисленной к лику местночтимых святых. Архиепископ Иоанн совершил Божественную Литургию в сослужении духовенства епархии и молебен у раки с мощами угодницы Божией.

9 июня 2013 года в Свято-Духовском кафедральном соборе Херсона духовенство и верующие чествовали память праведного Иоанна Русского - небесного покровителя собора, чтимая икона которого со святыми его мощами пребывает на протяжении шести лет в соборе. Накануне, вечером 8 июня, Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн, в сослужении соборного духовенства, совершил Всенощное бдение, а в самый день праздника – Божественную Литургию и молебен у чтимой иконы святого угодника Божия. В своей проповеди Владыка Иоанн поздравил всех с продолжающимся праздником Пасхи и с днем памяти прав. Иоанна Русского. Владыка рассказал о жизни, подвигах и чудесах этого почитаемого и любимого во всем христианском мире святого. В завершение праздничной службы все были помазаны святым елеем, привезенным Архиепископом Иоанном из паломнической поездки от мощей святого Иоанна Русского с греческого острова Эвбея.

7 июня 2013 года, в день памяти святителя Иннокентия Херсонского, Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн посетил Иннокентиевскую церковь в Северном микрорайоне Херсона и совершил в ней Божественную Литургию. В этот день духовенство и прихожане праздновали престольный праздник, на который собрались верующие и из других херсонских храмов. По окончании Литургии состоялся крестный ход вокруг храма со чтимой иконой святителя Иннокентия. Архиепископ Иоанн тепло поздравил всех с праздником и пожелал, чтобы молитвенным предстательством святителя Иннокентия Херсонского в наших сердцах укреплялись вера, надежда и любовь – одни из самых главных христианских добродетелей.

6 июня 2013 года, в день памяти блаженной Ксении Петербургской, Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн посетил Никольский скит Благовещенского женского монастыря, расположенный в с. Радгоспное Скадовского района. Владыка Иоанн возглавил Божественную Литургию на месте строящегося храма в честь блаженной Ксении Петербургской, закладка которого была совершена 11 мая этого года. В своей проповеди Владыка поздравил всех с днем памяти этой всеми любимой и почитаемой святой, а также с совершением первой Божественной Литургии в  храме, посвященном ей.

5 июня 2013 года Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн совершил Божественную Литургию в Благовещенском женском монастыре с. Приозерное. В обители праздновался престольный праздник в честь преподобной Евфросинии Полоцкой, память которой Святая Церковь совершает в этот день. Архиепископ Иоанн тепло поздравил настоятельницу обители, сестер и прихожан с престольным праздником и пожелал, чтобы по молитвам преподобной Евфросинии Полоцкой Всемилостивый Господь помогал Благовещенской обители быть ярким светильником православной веры, свет от которого сможет освещать путь многих верующих, идущих за Христом.

С 23 мая по 1 июня 2013 года паломническая группа во главе с Архиепископом Херсонским и Таврическим Иоанном посетила православные святыни Греции. Паломники молились на Святой Горе Афон в монастырях: Пантелеимон, Великая Лавра, Хилендар, Дохиар, Ватопед, Иверон; в скитах: Ксилургу, Андреевском и Ильинском и др. 26 мая в Покровском храме Пантелеимоновского монастыря Архиепископ Иоанн совместно с Епископом Ивано-Франковским и Коломийским Пантелеимоном совершил Божественную Литургию.

По благословению Архиепископа Херсонского и Таврического Иоанна в Херсонском епархиальном управлении состоялся учебный семинар-тренинг «Как составить социальный православный проект». По приглашению отдела социального служения и благотворительности Херсонской епархии для проведения тренинга из Москвы прибыл Константин Старостин, руководитель отдела сопровождения проектов конкурса «Православная инициатива».

24 мая 2013 года, по благословению Архиепископа Херсонского и Таврического Иоанна, в помещении Херсонского государственного университета состоялась ІІ международная научно-практическая конференция «Государственно–конфессиональное взаимодействие в социальной работе». Организаторами конференции стали отдел социального служения и благотворительности Херсонской епархии, областной центр социальных служб для семьи, детей и молодежи, институт истории, психологии и социальной работы ХГУ, областная организация Лиги социальных работников Украины.