25 декабря 2009 года, в день, когда Святая Церковь празднует память святителя Спиридона Тримифунтского Чудотворца, Архиепископ Херсонский и Таврический Иоанн, освятил престол Преображенского нижнего храма Свято-Духовского кафедрального собора, после чего совершил праздничную Божественную Литургию. Под престолом храма были положены частицы мощей святого апостола Иакова, брата Господня и святого преподобномученика Игнатия Богоносца, а также камень со святой горы Фавор.

В 2006 году Преображенский храм оказался в очень бедственном состоянии, так как в результате поднятия грунтовых вод и деформации водоотводящих коммуникаций фундамент и стены храма стали трескаться, а также в нем стали разрушаться прекрасные иконные росписи, украшающие его стены и свод. Несколько лет назад Преображенский храм был закрыт на реконструкцию и вот сегодня, к огромной радости духовенства и всех прихожан, храм снова открыт и в нем возобновлены богослужения.